【コロナ分析】新型コロナ日本感染ルーツとウイルスの種類：中国のゲノム分析から　変異は飛行機で浴びる放射線が主原因か

https://news.yahoo.co.jp/byline/endohomare/20200310-00166933/
　中国の研究者らが新型コロナウイルスのゲノム配列に関して暫定的な研究結果を発表した。
それにより日本で感染しているウイルスのルーツや種類も見えてきた。飛行機搭乗とも関係し日本の対策の是非の参考になる。

◆ウイルス経路マップーー日本人感染者のルーツとウイルスの種類が見える
2月21日、中国科学院シーサンパンナ熱帯植物園(雲南省)に在職する研究者である郁文彬博士（Wen-Bin Yu Ph. D）等が
「新型コロナウイルス肺炎の進化(変異)と感染を全てのゲノム学的なデータに基づいて解読する
（Decoding　evolution and transmissions　of novel pneumonia　coronavirus (SARS-CoV-2) using the whole genomic data）」という論文(以下、論文)を
中国科学院の学術論文プレプリント・サーバーChinaXivに投稿した。

※中略

論文は93件のウイルスサンプルの遺伝子情報を調べて比較し、以下のような変異と感染の経路マップを作成している。

※経路マップはソースで

では、経路マップの読み方をご紹介しよう。
先ず「H」という文字を用いているのは、Haplotype （ハプロタイプ）という、ウイルスの識別番号のようなものの頭文字を指しているからである。
ウイルスの種類を左上の国・地域と中国のいくつかの代表的な地区名に沿って調査し、その起源と伝染ルートを描いている。
次にウイルスの大きな枠での類似性を、Group AからEに大別している。
日本は青色で区別され、Group AのH53（2例）とH52（1例）、Group CのH51 （1例）とH32（1例）が日本の患者だ。論文の詳細なデータによれば、
●Group AのH53とH52：東京(計3例)
●Group CのH51（1例）：京都
　　　　　　　H32（1例）：愛知
となっている。
何しろ全世界で93例しかサンプルが取れてないので、まだ研究段階であり、作者自身「どうか皆さん、サンプルを提供して下さい」と論文の中で呼び掛けている。
私たちの関心事は、日本の患者がどこから来た、どのような種類のウイルスで発病したのかを突き止めることだが、先に結論を言えば、
Group Aは(武漢滞在歴がある）深セン経由のウイルスなので、先ずは広東省を日本は入国禁止地区に入れなければならなかったことが分かる。
Group Cは湖北省武漢市の海鮮市場由来のウイルスなので、湖北省を入国規制区域にしたのは正しいが、しかし「H51」は、「広東省」で突然変異した亜種なので、
やはり広東省を入国禁止地区に指定していなければならなかったことが分かる。
愛知県の「H32」は武漢の海鮮市場由来のものである。

◆グループ別のウイルスの起源と感染経路
では、グループ別にウイルスの起源と感染経路を見てみよう。

Group A
「H13」を中心として広がったウイルスで、これは深セン(広東省、緑色)においてのみ発見された種類だ。
深センで家族感染したが、東京と行き来していたらしく、広東省由来の東京の患者が3人もいる(2月12日時点で)。
「H13」はどのようにして生まれたかというと、コウモリから発見されたウイルス「bat-RaTG13」が、何やら確定できない動物を介して「mv1」ウイルスとなった。
ここは明確には辿られてないので、細い線で結ばれている。
※中略

Group B
※中略

Group C
これこそが爆発的に伝染していった感染源だ。
図の下半分にある赤い色などを中心とした円の真ん中に「H１」と書いてある。少々不鮮明だが、「H１」は「武漢市華南海鮮市場」で見つかったウイルスだ。
大規模感染を起こし、世界中に広がっていった。「H１」が形成された変異経路には大きく分けて以下の二つの可能性が大きい。
●bat-RaTG13→H13→H3→H1
●bat-RaTG13→H38→H3→H1
だ。ここからが怖い。
「H１」はGroup Cに所属するが、ここから進化してGroup DやGroup Eなどの、言うならば「亜種」に変異している。

◆変異は飛行機で浴びる放射線が主原因か
論文は変異したウイルス保持者の足跡を調べることによって、変異の多くは飛行機に乗ったことにより上空の放射線を浴び、それによって
ゲノム配列が異なってしまった可能性が高いと分析している。
ウイルスは二重螺旋型の遺伝子配列であるDNAではなく、一重螺旋型のRNAなので、変異をそのままコピーし易い性質を持っているという。

※続きはソースで

雲南でなぜ日本の研究ぐされるんだよ

エジプトから帰国した川越のやつもヤバそう